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Détection des orthologues et des paralogues à l'aide de l'arbre phylogénétique - Softcover

 
9786208405786: Détection des orthologues et des paralogues à l'aide de l'arbre phylogénétique

Synopsis

L'orthologie et la paralogie sont des concepts centraux en biologie évolutive. La prédiction des orthologues (gènes homologues qui ont divergé en raison de la spéciation) et des paralogues (gènes homologues qui ont divergé en raison de la duplication) fait partie intégrante de nombreuses méthodes de génomique comparative. Un certain nombre de méthodes sont utilisées pour déduire l'orthologie et la paralogie. Les orthologues et les paralogues peuvent être déduits à l'aide de méthodes basées sur les graphes et de méthodes basées sur la phylogénétique. Cependant, les méthodes basées sur les analyses phylogénétiques sont très proches de la définition originale de l'orthologie et de la paralogie et sont connues pour être précises. Dans le présent travail, un pipeline pour la détection des orthologues et des paralogues est développé sur la base de l'approche phylogénétique. Un ensemble de protéines a été téléchargé à partir d'UniProt et une base de données a été développée. Des orthologues et des paralogues ont été détectés pour la séquence de la protéine interrogée. L'algorithme de chevauchement des espèces et le seuil de distance patristique par paire ont été utilisés pour identifier une prédiction précise et ajustée des paralogues et des orthologues. Une interface conviviale a été développée pour faciliter l'utilisation.

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Malhi, Manpreet Singh; Kaur, Sukhdeep
Published by Editions Notre Savoir, 2024
ISBN 10: 6208405785 ISBN 13: 9786208405786
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Manpreet Singh Malhi
Published by Editions Notre Savoir, 2024
ISBN 10: 6208405785 ISBN 13: 9786208405786
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Paperback. Condition: new. Paperback. L'orthologie et la paralogie sont des concepts centraux en biologie evolutive. La prediction des orthologues (genes homologues qui ont diverge en raison de la speciation) et des paralogues (genes homologues qui ont diverge en raison de la duplication) fait partie integrante de nombreuses methodes de genomique comparative. Un certain nombre de methodes sont utilisees pour deduire l'orthologie et la paralogie. Les orthologues et les paralogues peuvent etre deduits a l'aide de methodes basees sur les graphes et de methodes basees sur la phylogenetique. Cependant, les methodes basees sur les analyses phylogenetiques sont tres proches de la definition originale de l'orthologie et de la paralogie et sont connues pour etre precises. Dans le present travail, un pipeline pour la detection des orthologues et des paralogues est developpe sur la base de l'approche phylogenetique. Un ensemble de proteines a ete telecharge a partir d'UniProt et une base de donnees a ete developpee. Des orthologues et des paralogues ont ete detectes pour la sequence de la proteine interrogee. L'algorithme de chevauchement des especes et le seuil de distance patristique par paire ont ete utilises pour identifier une prediction precise et ajustee des paralogues et des orthologues. Une interface conviviale a ete developpee pour faciliter l'utilisation. Shipping may be from our UK warehouse or from our Australian or US warehouses, depending on stock availability. Seller Inventory # 9786208405786

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Malhi, Manpreet Singh; Kaur, Sukhdeep
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ISBN 10: 6208405785 ISBN 13: 9786208405786
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Manpreet Singh Malhi
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ISBN 10: 6208405785 ISBN 13: 9786208405786
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Manpreet Singh Malhi
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ISBN 10: 6208405785 ISBN 13: 9786208405786
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Taschenbuch. Condition: Neu. nach der Bestellung gedruckt Neuware - Printed after ordering - L'orthologie et la paralogie sont des concepts centraux en biologie évolutive. La prédiction des orthologues (gènes homologues qui ont divergé en raison de la spéciation) et des paralogues (gènes homologues qui ont divergé en raison de la duplication) fait partie intégrante de nombreuses méthodes de génomique comparative. Un certain nombre de méthodes sont utilisées pour déduire l'orthologie et la paralogie. Les orthologues et les paralogues peuvent être déduits à l'aide de méthodes basées sur les graphes et de méthodes basées sur la phylogénétique. Cependant, les méthodes basées sur les analyses phylogénétiques sont très proches de la définition originale de l'orthologie et de la paralogie et sont connues pour être précises. Dans le présent travail, un pipeline pour la détection des orthologues et des paralogues est développé sur la base de l'approche phylogénétique. Un ensemble de protéines a été téléchargé à partir d'UniProt et une base de données a été développée. Des orthologues et des paralogues ont été détectés pour la séquence de la protéine interrogée. L'algorithme de chevauchement des espèces et le seuil de distance patristique par paire ont été utilisés pour identifier une prédiction précise et ajustée des paralogues et des orthologues. Une interface conviviale a été développée pour faciliter l'utilisation. Seller Inventory # 9786208405786

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Malhi, Manpreet Singh; Kaur, Sukhdeep
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Malhi, Manpreet Singh; Kaur, Sukhdeep
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Malhi, Manpreet Singh; Kaur, Sukhdeep
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Manpreet Singh Malhi
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ISBN 10: 6208405785 ISBN 13: 9786208405786
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Manpreet Singh Malhi
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ISBN 10: 6208405785 ISBN 13: 9786208405786
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