Signature génomique de 3 écotypes d'Ostreococcus, algues Prasinophytes: Analyse de leur génome (Omn.Univ.Europ.) - Softcover

Jancek, Severine

Softcover

ISBN 10: 6131584842 ISBN 13: 9786131584848

Publisher: Editions universitaires europeennes, 2011

Synopsis

Le genre Ostreococcus regroupe les plus petits organismes eucaryotes photosynthétiques connus à ce jour. Les génomes complets de 3 écotypes d'Ostreococcus, isolés à partir de 3 niches écologiques différentes, ont été séquencés. Ces écotypes correspondent à une souche de surface adaptée à une forte luminosité, une souche profonde adaptée à une faible luminosité, et une souche de surface polyvalente à la lumière. La comparaison des génomes a révélé une divergence en acides aminés inattendue entre les gènes orthologues (70% d'identité) alors que leurs séquences 18S ont une identité de 99%. La divergence entre ces 3 souches a été comparée avec les divergences de 4 lignées eucaryotes, et souligne le fait que le gène marqueur 18S sous-estime la divergence globale des organismes unicellulaires. La comparaison génomique des 3 Ostreococcus a permis d'identifier les fonctions des gènes orthologues et des gènes spécifiques. L'estimation des taux de substitution entre orthologues a permis d'identifier des gènes candidats à l'origine de l'adaptation de ces organismes à leur environnement, et suggère un rôle majeur des protéines transmembranaires dans l'évolution de ces espèces.

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About the Author

Severine Jancek, Docteur en biologie, ayant suivi des études de biologie et physiologie intégrative, et adaptation des organismes à l'environnement marin à l'Université de Pierre et Marie Curie de Paris. Chercheur postdoc CNRS en génomique comparative et adaptative à l'Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte, Tours (France).

Edition details

• Publisher: Editions universitaires europeennes
• Publication date: 2011
• Language: French
• ISBN 10: 6131584842
• ISBN 13: 9786131584848
• Binding: Paperback
• Number of pages: 192